Ｔｍ値の計算方式について
　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　　

製品添付の合成報告書に記載しているＴｍ値の具体的な計算方法は下記のとおりです。
（最近接塩基対パラメータ「Nearest Neighbor法」を取り入れています）

日本バイオサービス Tm値 計算方式
1M NaCl中における二重鎖の熱力学安定性(�僭°₃₇)は「最近接塩基対パラメータ (別表)」を用いて (1)式で計算されます。

　　�僭°_37,1MNaCl　(kcal・mol^-1)=　Σ�僭°_37,NN　　　・・・（１）

熱力学安定性（�僭°₃₇）と　溶解温度 Tｍの関係は経験式として非自己相補鎖の場合 (2)式により求められます。　

　　Tm^-1 (K) = -3.27×10^-3・�僭°₃₇^-1 + 2.77×10^-3 　・・・（２）

100 ｍM NaCl の塩濃度における溶解温度 Tmは（３）式により補正されます。

　　Tm_{0.1M NaCl} (K) = 0.891 Tm _{1M NaCl}+25.0 　　　　・・・（３）



(別表) 最近接塩基対パラメータ Thermodynamic parameters for duplex formations in 1 M NaCl-phosphate buffer

Sequence	�僭°37,NN kcal mol-1
AA/TT	-1.2
AC/TG	-1.5
AG/TC	-1.5
AT/TA	-0.9
CA/GT	-1.7
CC/GG	-2.1
CG/GC	-2.8
GA/CT	-1.5
GC/CG	-2.3
TA/AT	-0.9
Initiation	3.4

尚 長鎖の場合 や 自己相補鎖を一部含む配列の場合は 算出されたTm値に相当の誤差が生じることがあります。

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